在日本这一“怪兽大国”，人们的日常生活遭受着怪兽的无情破坏。 主人公日比野卡夫卡，小时候住的城市遭到破坏，他与青梅竹马亚白米娜做出了“将怪兽全部消灭”的约定。 然而，32岁的卡夫卡梦想破灭，就职于一家怪兽尸体解体公司“怪兽清洁公司”。 相比米娜作为日本防卫队队员而日渐活跃，卡夫卡每天都过着忧郁的生活。 过来打工的市川莱诺告诉他，防卫队的年龄限制将会提高，并劝他去参加入队考试。 于是重新下定决心的卡夫卡，却突然受到神秘生物的侵蚀，身体开始怪兽化，被称为“怪兽8号”。

距离“9·11”恐怖袭击，已经过去整整6年多了，不过美国仍然没有放弃对恐怖分子的打击与谴责，现在的总统阿什顿也总是处在全球对战恐怖主义的浪尖上。作为专责保护总统的秘密特工，托马斯·巴恩斯一年前曾在执行任务的时候中弹受伤，后来虽然枪伤恢复，精神状态却一直不大稳定，然而他却坚信自己能够再次担任起保护总统的任务了，与另一位特工肯特·泰勒一起随阿什顿抵达西班牙，在市中心的广场上发表演说……所有的事情几乎都发生在一瞬间，正在演讲的阿什顿遭到枪击，市区随即发生了几起大爆炸，硝烟的弥漫、飞溅的石块、痛苦的尖叫，广场顿时