《开学悸》由《伤疤》、《相见》和《自习室》三个故事组成，以风靡一时的真实校园怪谈为题材，使这些古老的传说在不同的时空中重现活力。影片以女生桃子独自在自习室等待男友的场景展开，男友在电话中给桃子讲了两个校园中的恐怖传说，直到两个故事结束，男友都没有出现，而与此同时，一个黑影正从桃子的身后慢慢接近她，就此展开了影片的第三个故事。

校霸童阳开学打架被停课，返校后遭到同学们的惧怕和疏远，偷偷躲起来哭的他意外被学霸萧真撞见，威胁不成反被揍。待人疏离的萧真不知为何开始给童阳补课，直到童阳发现原来开学和他打架的人，是萧真的弟弟……

“我想一定是在那一瞬间，我就喜欢上她了…”15岁的秋月大和怀抱着“只要来到东京，只要上高中，就会有所改变！”的想法，独自一人从故乡广岛县来到东京读高中，寄宿在阿姨开设的女子澡堂兼出租宿舍“旭汤”。开学的前一周，大和在学校里看到努力练习跳高的朝比奈凉风，对她一见钟情。更让大和感到意外的是，凉风竟然就住在他的宿舍隔壁间。原本看似一无是处的男主角，在开学后的五十米短跑测验跑出惊人成绩，受到田径社的青睐；大和原先毫无兴趣，但在对凉风告白被拒绝后，改变心意入社成为短跑选手，借此拉近两人之间的距离，并希望以自己的比赛